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Los potentes modelos de inteligencia artificial de Google Cloud para la investigación en atención médica y ciencias biológicas ahora están disponibles como flujos de trabajo de apuntar y hacer clic a través de la plataforma bioinformática de Form Bio, disponible en Google Cloud Marketplace

DALLAS, TX / ACCESSWIRE / 14 de marzo de 2024 / Formulario de biografía, el innovador proveedor de soluciones computacionales de ciencias biológicas, anunció hoy la disponibilidad de los innovadores modelos basados ​​en inteligencia artificial de Google Cloud para la investigación en ciencias biológicas y de atención médica como flujos de trabajo de apuntar y hacer clic a través de la plataforma bioinformática de Form Bio. Form Bio es socio Premier de Google Cloud y ayuda a las empresas a aprovechar Google Cloud Suite multiómica anunciado en 2023. Con este anuncio, Form Bio proporciona una vía para que los modelos ómicos basados ​​​​en Vertex AI de Google Cloud se utilicen apuntando y haciendo clic. Además, la plataforma bioinformática basada en la nube integral y fácil de usar de Form Bio ahora está disponible en Google Cloud Marketplace, lo que permite a los profesionales de las ciencias biológicas utilizar sus soluciones de inteligencia artificial en la infraestructura global confiable de Google Cloud.

Los modelos avanzados de IA/ML de Google Cloud ofrecen a los investigadores de ciencias biológicas una variedad de capacidades para analizar y transformar grandes conjuntos de datos biológicos mediante aprendizaje profundo, redes neuronales y más. Si bien ya están disponibles y son ejecutables a través de populares repositorios de código y soluciones de contenedorización, los mismos modelos de Google Cloud ahora se pueden ejecutar con solo unos pocos clics en la plataforma bioinformática fácil de usar de Form Bio, lo que reduce drásticamente las barreras entre las operaciones científicas de banco y las sofisticadas aplicaciones de Google Cloud. Innovaciones en IA/ML.

Ejemplos de modelos ómicos basados ​​en IA ahora disponibles a través de Form Bio incluyen:

  • Variante profunda: un llamador de variantes basado en aprendizaje profundo que toma lecturas alineadas (en formato BAM o CRAM), produce tensores de imágenes acumuladas a partir de ellas, clasifica cada tensor utilizando una red neuronal convolucional e informa los resultados en un archivo VCF o gVCF estándar.
  • ProfundoSomático: una extensión del llamador de variantes basado en aprendizaje profundo DeepVariant que toma lecturas alineadas (en formato BAM o CRAM) de datos normales y tumorales, produce tensores de imágenes acumuladas a partir de ellos, clasifica cada tensor usando una red neuronal convolucional y, finalmente, informa variantes somáticas en un archivo VCF o gVCF estándar. DeepSomatic admite llamadas de variantes somáticas a partir de datos de secuenciación normal de tumores.
  • trío profundo: Una extensión de DeepVariant destinada a realizar variantes de tríos o dúos. La principal ventaja de DeepTrio es que la herencia genética es considerada por una red neuronal para llamar variantes en muestras de trío. Además, las variantes candidatas se generan a partir de todas las muestras a la vez, lo que garantiza que se realice una llamada de genotipo para cualquier posición del trío con una variante. Dado que DeepTrio está construido sobre DeepVariant, la información general de DeepVariant también se aplica a DeepTrio.
  • DeepVariant para RNA-seq: Una extensión de DeepVariant, un llamador de variantes basado en aprendizaje profundo, para aprender y dar cuenta de los desafíos únicos que presentan los datos de RNA-seq. El modelo DeepVariant RNA-seq produce llamadas de variantes de alta precisión a partir de datos de secuenciación de ARN y supera a los enfoques existentes como Platypus y GATK.
  • Consenso profundo: Una pérdida basada en alineación para entrenar un codificador transformador con reconocimiento de espacios para la corrección de secuencia. DeepConsensus utiliza transformadores de secuencia con reconocimiento de brechas para corregir errores en los datos de secuenciación de consenso circular (CCS) de Pacific Biosciences (PacBio). Esto da como resultado un mayor rendimiento de lecturas de alta calidad.
  • Pulidor profundo: Un método de corrección de secuenciación basado en transformador similar a DeepConsensus. DeepPolisher está diseñado para identificar errores en ensamblajes de genomas. DeepPolisher toma lecturas específicas de haplotipos alineadas con ensamblajes en fases y produce un archivo VCF que contiene posibles errores en el ensamblaje.
  • Predicción de la estructura de la proteína AlphaFold: Un sistema de predicción de estructuras de proteínas basado en aprendizaje profundo desarrollado por Google DeepMind. AlphaFold puede ayudar a predecir estructuras de proteínas con una velocidad y precisión notables y ha superado a otros métodos en varios desafíos de predicción de estructuras de proteínas.

Estos modelos ayudan a los científicos a hacer un mayor uso de cantidades cada vez mayores de datos biológicos y, al mismo tiempo, aceleran los aspectos computacionales de su investigación. Al acceder a estas innovaciones de Google Cloud a través de Form Bio, los científicos de la vida pueden obtener nuevos conocimientos de ciencia de datos con poco esfuerzo y en una fracción del tiempo.

Form Bio ofrece una plataforma bioinformática basada en la nube integral y fácil de usar para ayudar a los profesionales de las ciencias biológicas a realizar más trabajo computacional más rápido. Creado de forma nativa en Google Cloud y utilizando otras innovaciones de Google Cloud, Form Bio permite a los científicos no técnicos administrar fácilmente sus datos, ejecutar los mejores flujos de trabajo de su clase y avanzar de manera colaborativa en los aspectos computacionales de su investigación. La solución se adapta a las necesidades del descubrimiento y desarrollo de fármacos, la biología sintética y la ingeniería genética, lo que reduce significativamente el tiempo y los recursos necesarios para avanzar en la investigación.

«Llevar Form Bio a Google Cloud Marketplace ayudará a los profesionales de las ciencias biológicas a implementar y administrar rápidamente modelos ómicos en la infraestructura global confiable de Google Cloud», dijo Dai Vu, director general de programas Marketplace e ISV GTM de Google Cloud. «Form Bio ahora puede escalar y apoyar de forma segura a los clientes en sus viajes de transformación digital».

Para comenzar a utilizar los modelos de Google y otros a medida que estén disponibles, explore los planes de precios y regístrese en Form Bio a través de Google Cloud Marketplace en https://formbio.com/start.

Para ver una visita guiada y una demostración de la plataforma Form Bio, incluidos los nuevos flujos de trabajo impulsados ​​por Google Cloud Vertex AI, regístrese en este seminario web organizado conjuntamente que tendrá lugar el 3 de abril de 2024 a las 10 a.m. (hora del Pacífico): https://info.formbio.com/google-omics-models-simplified-with-form-bio-webinar.

Acerca del formulario de biografía

Form Bio ofrece software galardonado y soluciones de inteligencia artificial a los líderes biofarmacéuticos, permitiéndoles acelerar sus objetivos científicos más ambiciosos. Al combinar datos, tecnología y experiencia, las soluciones de Form aceleran los plazos desde el descubrimiento hasta la clínica, proporcionando a los desarrolladores de fármacos información rápida en silicona caracterización, simulación y optimización de sus terapias, lo que permite mayores rendimientos, mayor seguridad y ciclos de desarrollo más cortos y menos costosos. Con experiencia interdisciplinaria que abarca ingeniería de software, biología, bioinformática y ciencia de datos, el equipo de Form Bio colabora estrechamente con los clientes en sus desafíos y oportunidades más urgentes y estratégicos. Para más información visite https://www.formbio.com/.

Información del contacto

Ángela Anderson
Formulario de biografía
angela@formbio.com

Jake Robinson
Inizio Evocar comunicaciones
jake.robison@inizioevoke.com

FUENTE: Formulario de biografía

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