Sapienteuna organización líder en el descubrimiento de biomarcadores que brinda servicios a escala para la generación y análisis de datos multiómicos, anunció hoy un avance importante en su espectrometría de masas Servicios de metabolómica y lipidómicaSapient ha generado una biblioteca de estándares comerciales líder en la industria, que abarca más de 10 000 estándares de referencia química enriquecidos para vías metabólicas humanas y preclínicas clave, procesos bioquímicos y factores desencadenantes de enfermedades, y que abarcan más de doce superfamilias químicas. Los estándares se han analizado exhaustivamente utilizando la infraestructura de espectrometría de masas de última generación de Sapient para generar datos sólidos y multiparamétricos que permiten una identificación rápida y de alta precisión de “Nivel 1+” de más de 1000 metabolitos y lípidos que se encuentran rutinariamente en biomuestras humanas. Las identificaciones de Nivel 1+ de Sapient superan los criterios aceptados por la industria para Tier 1 Identificación de metabolitos establecida por la Iniciativa de Estándares de Metabolómica (MSI) mediante el uso de tres parámetros químicos ortogonales para confirmar la identidad, incluido el tiempo de retención de referencia (RT), la relación masa-carga (m/z) de MS1 y la huella química de MS2. En conjunto, estos datos mejoran la velocidad, la calidad y el alcance de las capacidades de identificación de metabolitos de Sapient, de modo que se puedan interrogar de manera efectiva más metabolitos y lípidos estadísticamente significativos y avanzar a estudios de validación.
Aumentar la escala y la precisión de la identificación de metabolitos tiene un valor científico fundamental para los clientes de Sapient. Una molécula identificada químicamente se puede vincular a procesos y vías biológicas para dilucidar su papel en la salud, la enfermedad y la respuesta a los fármacos, explica el Dr. Mo Jain, MD, PhD, fundador y director ejecutivo de Sapient. “Los métodos de metabolómica y lipidómica no dirigidos ahora nos permiten capturar miles de moléculas pequeñas en una sola muestra, pero aumentar la cantidad de moléculas ‘conocidas’ o identificables encontradas en estos análisis de descubrimiento ha sido un desafío para la industria, lo que limita la traducibilidad de los hallazgos”, dijo. “Lo que es realmente emocionante es que con la amplitud y profundidad de los datos que hemos recopilado ahora, podemos identificar más compuestos que nunca, con los más altos niveles de confianza. Hemos realizado una inversión significativa en la recopilación de los datos necesarios para que nuestros descubrimientos de biomarcadores puedan ponerse en práctica rápidamente y hacer avanzar los programas de desarrollo de fármacos de nuestros clientes”.
Además de proporcionar una mayor cantidad de identificaciones definitivas de compuestos, Sapient puede aprovechar su extensa base de datos de estándares para dilucidar más moléculas “desconocidas” y avanzar en nuevos descubrimientos. Los datos se generaron para una amplia gama de estándares químicos, desde metabolitos humanos endógenos hasta pequeñas moléculas derivadas de plantas, y moléculas originadas en alimentos y aditivos alimentarios, medicamentos aprobados por la FDA, tóxicos ambientales y contaminantes. “Si una molécula de interés no coincide exactamente en nuestra base de datos, aún podemos identificar similitudes estructurales con nuestros estándares de referencia, lo que nos ayuda a comprender mejor su química y papel biológico y brinda mayor confianza al análisis”, dijo el Dr. Saumya Tiwari, cofundador y director de química computacional en Sapient. “Hemos generado datos MS2 para todos estos estándares y, en conjunto, ahora tenemos más de 6 millones de espectros MS2 para 600 000 compuestos con los que podemos realizar comparaciones para dilucidar estructuralmente y anotar con confianza los metabolitos y lípidos aún identificados. “El aumento tanto del potencial de descubrimiento como de la traducibilidad es bastante significativo”.
“Nuestro objetivo es ayudar a nuestros clientes a descubrir y validar rápidamente las señales biológicamente más importantes en sus muestras, ya sean moléculas conocidas o aún por mapear”, afirmó el Dr. Jain. “La expansión de nuestras capacidades de identificación de metabolitos nos brinda una capacidad inigualable para descubrir los conocimientos que contienen los biomarcadores de moléculas pequeñas y garantizar que los hallazgos sean reproducibles para avanzar con confianza en su estudio”.