Tag: SHAP

Creación de un cocientífico QSAR de bosque aleatorio dividido en andamios para el descubrimiento de inhibidores de EGFR utilizando ChEMBL, RDKit, SHAP y BRICS

bandera(“ MINERÍA DE BIOACTIVIDAD (actividades ChEMBL -> pIC50)”) def pull_activities(tid, cap): url, filas = f”{BASE}/actividad”, params = {“target_chembl_id”: tid, “standard_type”: “IC50”, “pchembl_value__isnull”: “false”, “limit”: 1000, “format”: “json”} js = http_json(url,…

Una guía de codificación que implementa flujos de trabajo de explicabilidad SHAP con comparaciones de explicadores, enmascaradores, interacciones, deriva y modelos de caja negra

print(“\n” + “=”*72) print(“PARTE 3: Descomposición de la interacción”) print(“=”*72) inter = tree_expl.shap_interaction_values(X_te.iloc) inter_abs = np.abs(inter).media(0) diag = np.diagonal(inter_abs).copia() off = inter_abs.copia(); np.fill_diagonal(off, 0) main_share = diag.sum() / (diag.sum() +…