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Las muestras se almacenan habitualmente de una forma que degrada el ARN. Los científicos están ideando nuevas formas de superar este obstáculo para la secuenciación del ARN.
Twist RNA Exome detecta más objetivos con menos lecturas.
Biociencia Twist
La secuenciación de ARN (RNA-seq) es una herramienta poderosa Para biólogos moleculares que buscan qué impulsa los mecanismos de la enfermedad.1 La secuenciación de ARN se utiliza rutinariamente tanto para investigación como para aplicaciones clínicas en enfermedades que presentan altos niveles de dinamismo genético y heterogeneidad. como el cáncer.2 Sin embargo, aunque la secuenciación de ARN es cada vez más accesible y frecuente, presenta obstáculos técnicos que pueden impedir que los científicos obtengan los datos de alta calidad que necesitan.
El ARN está más sujeto a la degradación que el ADN, ya sea química, física o enzimática. Para complicar el asunto, los científicos que realizan investigaciones sobre enfermedades dependen de muestras de tejido clínico como fuentes de ARN. Estas muestras suelen estar fijadas con formalina e incluidas en parafina (FFPE), un proceso que preserva la integridad de la muestra a largo plazo para el análisis inmunohistoquímico, pero que puede dar lugar a ARN altamente degradado.2
Los científicos están diseñando protocolos, reactivos y kits de preparación de bibliotecas de ARN adaptados a las muestras FFPE para eliminar este obstáculo. Twist Bioscience, por ejemplo, ofrece un Kit de preparación rápida de bibliotecas Diseñado para funcionar con muestras FFPE y otras muestras de bajo consumo, el kit se completa en tan solo 4,5 horas de principio a fin. El protocolo incluye un paso de depleción opcional para eliminar el ARN ribosómico y globínico, dejando solo el ARN mensajero. También incorpora nucleótidos dUTP durante la síntesis de la segunda cadena, lo que permite a los científicos rastrear las secuencias amplificadas hasta las cadenas originales.
El kit de preparación de bibliotecas de ARN Twist está pensado para ser un primer paso importante en el proceso de secuenciación de ARN y, por lo tanto, está diseñado para combinarse con otras soluciones de enriquecimiento de objetivos, como el panel de exoma de ARN (que enriquece todo el transcriptoma) o el panel de fusión de ARN (que se centra en genes de fusión específicos relevantes para el cáncer). Por último, Twist Bioscience también puede diseñar paneles personalizados para científicos con una aplicación y un objetivo únicos en mente.
Obtenga más información sobre el Soluciones disponibles para maximizar la secuenciación de ARN utilizando muestras FFPE.
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