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Los kits de extracción de ARN y ADN toman por asalto muestras de tejido fijadas con formalina, lo que permite una calidad y rendimiento superiores.
Los investigadores extraen ARN y ADN de muestras biológicas como punto de partida para diversas aplicaciones biomoleculares posteriores, como secuenciación de próxima generación, PCR y análisis de microarrays. Los pasos generales para la extracción de ácidos nucleicos implican lisar células, inactivar nucleasas y purificar la muestra de ácido nucleico de los restos celulares sobrantes. Entre las consideraciones más importantes para realizar un trabajo confiable Extracción de ARN y ADN. son la pureza y el rendimiento de la muestra final, ya que estas variables afectan en gran medida los flujos de trabajo posteriores.1 Aislar ARN y ADN de tejido fresco, muestras de células y geles de agarosa es relativamente sencillo y eficaz. Sin embargo, aislar ácidos nucleicos a partir de muestras de tejido fijadas con formalina e incluidas en parafina (FFPE) no es una tarea fácil, dada la composición química. daño que imparte el formaldehído que preserva los tejidos.2
La extracción de ARN y ADN de mayor calidad y mayor rendimiento a partir de muestras de tejido fijadas con formalina e incluidas en parafina permite a los investigadores maximizar los materiales de los biobancos para una amplia variedad de aplicaciones.
BIOTIO
Las muestras de tejido FFPE permiten a los científicos obtener información útil de la arquitectura de células y tejidos preservados, pero la preservación con formaldehído entrecruza proteínas y ácidos nucleicos y interrumpe secuencias de nucleotidos.3,4 Como resultado, la calidad y el rendimiento del ARN y el ADN de las muestras FFPE suelen ser deficientes, lo que limita las aplicaciones posteriores que requieren suficiente material de partida. Existen importantes beneficios al extraer calidad y rendimiento adecuados de ácidos nucleicos de muestras FFPE. Por ejemplo, aprovechar los materiales de archivo de los biobancos, como las biopsias de tejido, amplía el alcance de la investigación básica sobre cáncer e inmunología, el diagnóstico médico, el desarrollo terapéutico y los estudios clínicos retrospectivos y prospectivos.
Los investigadores que utilizan protocolos de extracción estándar que calientan muestras para eliminar los enlaces cruzados inducidos por formaldehído se enfrentan a rendimientos y calidad de ácido nucleico deficientes y, por lo tanto, buscan nuevas tecnologías que permitan la extracción de ARN y ADN de muestras FFPE. Por ejemplo, Kits RNAstorm™ y DNAstorm™ de Biotium permiten obtener rendimientos de ARN y ADN más amplificables a partir de muestras de tejido FFPE, en comparación con otros métodos. Estos kits utilizan tecnología catalítica CAT5™, que permite a los investigadores eliminar de manera más eficiente los enlaces cruzados de formaldehído en condiciones más suaves, generando ADN y ARN más amplificables para aplicaciones posteriores.
Obtenga más información sobre las características únicas de Biotium. Kits de extracción FFPE RNAstorm™ y DNAstorm™.
Referencias
- Tan SC, Yiap BC. J Biomed Biotecnología. 2009;2009:574398
- Srinivasan M, et al. Am J Pathol. 2002;161(6):1961-71
- Williams C, et al. Am J Pathol. 1999;155(5):1467-71
- Do H, Dobrovic A. Clínica Química. 2015;61(1):64-71