Control de calidad integral y análisis interactivo de datos de secuenciación de ARN unicelular

Este seminario web se realizará en vivo y estará disponible bajo demanda.

Jueves 14 de diciembre de 2023
2:30 p. m. hora del este

Los científicos utilizan la secuenciación de ARN unicelular (scRNA-seq) para obtener información sobre la heterogeneidad celular dentro de tejidos complejos. Pueden estar presentes varios artefactos técnicos en los datos de scRNA-seq y deben evaluarse antes de realizar análisis posteriores. En esta charla técnica, Joshua Campbell discutirá los fundamentos del análisis scRNA-seq y los enfoques apropiados para manejar diversos desafíos.

Objetivos de aprendizaje

  • Control de calidad integral para el análisis de secuenciación de ARN unicelular
    • Separación de gotas vacías de células verdaderas.
    • Eliminación de células de mala calidad.
    • Detección de doblete
    • Estimación de ARN ambiental.
  • Análisis posterior de datos de scRNA-seq.
    • Asociación con fenotipos a nivel de muestra.
    • Etiquetado celular automatizado
    • Enriquecimiento del conjunto de genes
    • Análisis de comunicación célula-célula.

Josué Campbell, PhD
Profesor asociado de medicina
Sección de Biomedicina Computacional
Facultad de Medicina Chobanian y Avedisian de la Universidad de Boston

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